Analisi del ctDNA ad alta sensibilità rivela segnali rilevanti sfuggiti al sequenziamento di nuova generazione (NGS) nel cancro al pancreas.

Gli scienziati della Northwestern Medicine hanno dimostrato che un esame del sangue altamente sensibile può rilevare tracce di cancro al pancreas non individuate dai test standard, aiutando potenzialmente i medici a identificare i pazienti con maggiori probabilità di recidiva anche quando le scansioni appaiono rassicuranti. L’esame del sangue, particolarmente sensibile, si concentra sul gene KRAS, una mutazione genetica responsabile di oltre il 90% dei casi di cancro al pancreas. Questi risultati giungono mentre un nuovo farmaco rivoluzionario, mirato al gene KRAS, sta dimostrando notevoli benefici in termini di sopravvivenza ed è in procinto di essere approvato dalla FDA.

“Con l’avvento dell’era delle terapie mirate al gene KRAS, disporre di uno strumento di screening in grado di individuare la stessa mutazione diventa sempre più importante”, ha affermato l’autore senior dello studio, il dottor Akhil Chawla, professore associato di chirurgia clinica presso la Northwestern University Feinberg School of Medicine e oncologo chirurgo specializzato in interventi complessi presso la Northwestern Medicine.

“Questa combinazione potrebbe cambiare radicalmente il modo in cui identifichiamo i pazienti ad alto rischio, monitoriamo la malattia a livello microscopico e potenzialmente interveniamo prima che la recidiva diventi clinicamente visibile, consentendo in definitiva a un maggior numero di pazienti di guarire”, ha aggiunto.

Lo studio è stato pubblicato sulla rivista Clinical Cancer Research .

Il cancro al pancreas è una delle neoplasie più letali, anche quando viene diagnosticato prima che si diffonda visibilmente. Molti pazienti si sottopongono a mesi di chemioterapia e interventi chirurgici, eppure il tumore spesso si ripresenta.

“In questi pazienti, i livelli di DNA tumorale circolante sono spesso estremamente bassi e difficili da rilevare”, ha affermato Chawla. “Molti pazienti e le loro famiglie mi chiedono: ‘Come facciamo a sapere se la terapia sta funzionando?’ Questa ricerca si propone di dare una risposta più precisa a questa domanda.”

Lo studio ha seguito 106 pazienti del Northwestern Medicine affetti da tumore al pancreas localizzato, dalla diagnosi fino alla chemioterapia e all’intervento chirurgico. Al momento della diagnosi, lo studio ha rilevato che il test del sangue più sensibile, la PCR a gocce digitali (ddPCR), ha individuato segni di cancro in quasi quattro volte più pazienti rispetto ai test di sequenziamento di nuova generazione (NGS) convenzionali, che sono più comunemente utilizzati. Anche dopo la chemioterapia e l’intervento chirurgico, la ddPCR ha continuato a rilevare il cancro nella maggior parte dei pazienti, mentre l’NGS e i test standard non lo hanno fatto.

“Questo suggerisce che, utilizzando i metodi diagnostici attualmente disponibili, i medici potrebbero non rilevare la malattia residua nella maggior parte dei pazienti”, ha spiegato Chawla.

Una migliore individuazione ha portato a una migliore previsione degli esiti di sopravvivenza, ha scoperto il team di Chawla. L’esempio più chiaro è stata la scoperta di un gruppo di pazienti ad alto rischio, precedentemente non individuato, il cui tumore non era stato rilevato dal sequenziamento di nuova generazione (NGS) standard, ma è stato individuato tramite ddPCR. Questo gruppo è sopravvissuto in media 27 mesi dopo la diagnosi, rispetto ai 41 mesi dei pazienti risultati negativi a entrambi i test.

Ricerca più approfondita di KRAS

NGS e ddPCR sono esami del sangue (spesso chiamati biopsie liquide ) che ricercano tracce di DNA rilasciato dalle cellule tumorali nel flusso sanguigno. L’individuazione di questo DNA tumorale fornisce un segnale precoce della presenza del cancro o di una sua possibile recidiva. Poiché questi test si basano su un semplice prelievo di sangue, possono essere ripetuti nel tempo senza richiedere procedure invasive.

Sebbene entrambe le tecniche siano sempre più diffuse in oncologia, il sequenziamento di nuova generazione (NGS) è più comunemente utilizzato perché permette di ricercare simultaneamente un gran numero di geni associati al cancro. Al contrario, la ddPCR ricerca un insieme di geni alla volta. In questo studio, il team della Northwestern University ha utilizzato la ddPCR per concentrarsi specificamente sulle stesse mutazioni del gene KRAS che sono il bersaglio di nuovi farmaci in fase di approvazione da parte della FDA.

Gli scienziati hanno raccolto campioni di sangue dai partecipanti allo studio (tutti arruolati in una sperimentazione clinica più ampia) prima del trattamento, dopo la chemioterapia e dopo l’intervento chirurgico tra ottobre 2020 e ottobre 2024.

• Al momento della diagnosi, la ddPCR ha rilevato il DNA del KRAS tumorale nel 65% dei pazienti, rispetto al 17% rilevato con la NGS.
• Dopo la chemioterapia, la ddPCR ha rilevato il DNA KRAS del tumore nel 60% dei pazienti, rispetto al 5% rilevato con la NGS.
• Dopo l’intervento chirurgico, la ddPCR ha rilevato il DNA KRAS del tumore nel 56% dei pazienti, rispetto al 9% rilevato con la NGS.
• I pazienti risultati positivi a entrambi i test sono sopravvissuti in media per 11 mesi.
• Patients negative on both tests survived for 41 months on average
• I pazienti non rilevati dal sequenziamento di nuova generazione (NGS) ma individuati tramite ddPCR sono sopravvissuti in media per 27 mesi.

Chawla ha affermato che i risultati devono essere convalidati in studi multicentrici più ampi prima che la ddPCR possa essere utilizzata di routine nella cura del cancro al pancreas.

Abstract

Scopo: L’adenocarcinoma duttale pancreatico (PDAC) presenta un’elevata mortalità nonostante la terapia multimodale e sono necessari biomarcatori più precisi per guidare la gestione perioperatoria. Questo studio ha valutato il significato prognostico del DNA tumorale circolante (ctDNA) con mutazione KRAS, rilevato mediante sequenziamento di nuova generazione (NGS) e PCR a goccia digitale (ddPCR), nel PDAC localizzato.

Disegno sperimentale: In questo studio prospettico di coorte (2020-2024), sono stati arruolati pazienti con PDAC localizzato sottoposti a chemioterapia neoadiuvante (NAC) presso diversi centri della Northwestern Medicine. I campioni di sangue per la determinazione del ctDNA sono stati analizzati al momento della diagnosi, dopo la NAC e dopo la resezione, utilizzando NGS e ddPCR, tecniche indipendenti dal tumore, mirate alle mutazioni KRAS G12D/V/R. La sopravvivenza globale (OS) è stata valutata mediante analisi di Kaplan-Meier.

Risultati: La coorte comprendeva 106 pazienti. Al momento della diagnosi, il ctDNA di KRAS è stato rilevato nel 17,2% (17/99) dei pazienti mediante NGS e nel 64,9% (63/97) mediante ddPCR. Il rilevamento tramite entrambe le piattaforme è risultato associato a una sopravvivenza globale (OS) più breve, con il test ddPCR ad alta sensibilità che ha fornito una maggiore discriminazione prognostica identificando ulteriori pazienti con esiti sfavorevoli non rilevati dall’NGS (OS mediana con NGS 11,2 vs 30,5 mesi, p<0,001; OS mediana con ddPCR 24,7 vs 70,9 mesi, p=0,004). Stratificando per metodo di rilevamento, l’OS mediana è risultata più breve nei pazienti con ctDNA rilevato sia da NGS che da ddPCR (10,9 mesi), più lunga in quelli non rilevati da nessuna delle due piattaforme (40,7 mesi) e intermedia nei pazienti rilevati solo da ddPCR (26,9 mesi; p<0,001).

Conclusioni: Nel PDAC localizzato, il ctDNA con mutazione KRAS rilevato mediante NGS o ddPCR è risultato associato a una prognosi peggiore. La ddPCR ha identificato ulteriori pazienti non rilevati dall’NGS. L’integrazione della ddPCR con le misurazioni del ctDNA tramite NGS potrebbe migliorare la stratificazione del rischio perioperatorio, sebbene sia necessaria una validazione prima dell’implementazione clinica.

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